آنزیم DNA پلیمراز آلفا (α): این آنزیم در همانند سازی DNA سلول های یوکاریوت نقش اصلی و مرکزی را دارد و عمل پلیمریزاسیون DNA به صورت قطعات اوکازاکی را به عهده دارد و در طویل شدن رشته تاخیر (lagging) نقش دارد.
این آنزیم فعالیت پرایمازی برای ساخت RNA آغازگر یا پرایمر را دارد و مشابه DNA پلیمراز lll پروکاریوت ها عمل می کند. همچنین نقش تصحیح بازهای اشتباه (proof reading) را نیز به عهده دارد. در شروع همانند سازی، رشته راهنما جهت تشکیل RNA آغازگر نقش دارد، ولی نمی تواند رشته راهنما را بسازد. مرکز آن در هسته، سرعت عمل آن متوسط، میزان خطای آن 4-10 است و خاصیت اگزو نوکلئازی ندارد. DNA پلیمراز α الیگومر با 4 یا 5 زیر واحد است. زیر واحدهای آن دارای وزن مولکولی 180، 75، 49، 55، 50 کیلو دالتون است. زیر واحدهایی که وزن مولکولی آنها بین 50 و 55 کیلو دالتون است، فعالیت پرایماز دارند. امروزه معتقدند DNA پلیمراز آلفا (α) در سنتز رشته رهبر و رشته پیرو همکاری می کند.
آنزیم DNA پلیمراز بتا (β): آنزیم هسته ای است که نقش ترمیم کننده بخش های آسیب دیده DNA را به عهده دارد و در اصلاح و تعمیر DNA عمل می کند. سرعت عمل این آنزیم پایین و میزان خطا 4-10 × 5 است و خاصیت اگزو نوکلئازی ندارد. این آنزیم نسبت به افیدی کولین و بوتیل فنیل dGTP حساس است.
آنزیم DNA پلیمراز گاما (γ): در میتوکندری و احتمالا در کلرو پلاست است. به وسیله ژنوم هسته ای کد گذاری می شود و در سیتوپلاسم ساخته می شود. سپس وارد میتوکندری شده و عمل همانند سازی DNA میتوکندری یا mtDNA را به روش D-loop انجام می دهد.
آنزیم DNA پلیمراز دلتا (δ): این آنزیم رشته راهنما (leading) را می سازد. DNA پلیمراز δ فعالیت پرایماز ندارد و RNA آغازگر نمی سازد. میزان خطا این آنزیم 5-10 × 2 است. سرعت عمل این آنزیم وابسته به PCNA است و خاصیت اگزو نوکلئازی`3 به`5 دارد. بین DNA پلیمراز δ و هلیکاز ارتباط وجود دارد. این آنزیم نسبت به افیدی کولین حساس و نسبت به بوتیل فنیل dGTP مقاوم است. چرخ (Rollingclanp) این آنزیم PCNA نام دارد که فعالیت ممتد آن را افزایش می دهد.
آنزیم DNA پلیمراز اپسیلون (ε): نقش ترمیم کننده بخش های آسیب دیده DNA را به عهده دارد. همچنین در همانند سازی و پلیمریزاسیون DNA هسته ای شرکت می نماید و خصوصیات آن مانند DNA پلیمراز δ است. در هنگام ترمیم می تواند جانشین آن شود. سرعت عمل این آنزیم بسیار زیاد است و وابسته به PCNA نیست. میزان خطای آن 6-10 × 5 است و خاصیت اگزونو کلئازی`3 به`5 دارد. آنزیم ها با فعالیت`3 به`5 اگزو نوکلئازی اشتباهات خود را تصحیح می کنند.